derfinder

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅derfinder。

Annotation-agnostic微分表达式分析RNA-seq数据分辨率碱基对通过DER查找器方法

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了annotation-agnostic微分函数表达式RNA-seq数据的分析。德仪的两个实现方法都包含在这个包中:(1)单级统计量和(2)表示regions-level DER识别。DER Finder方法也可以用来识别不同界ChIP-seq峰值。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre)Alyssa c . Frazee[所有],安德鲁·e·贾菲(aut)黑色,杰弗里·t .韭菜(aut)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“derfinder”)):

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“derfinder”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“derfinder”)

biocViews