德科
DOI:10.18129 / B9.bioc.deco
此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见德科．
使用Omic数据分析分解异构队列
Bioconductor版本:3.12
该软件包通过包括子抽样LIMMA和NSCA在内的两步方法发现异质和同质组学数据中的差异特征。DECO揭示了与隐藏子类的特征关联，而不完全与更高的去监管级别相关。
作者:Francisco Jose Campos-Laborie, Jose Manuel Sanchez-Santos和Javier De Las Rivas。生物信息学和功能基因组学组。癌症研究中心(CiC-IBMCC, CSIC/USAL)。萨拉曼卡。西班牙。
维护者:Francisco Jose Campos Laborie
引文(从R内，输入引用(“装饰”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("deco")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“装饰”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 德科 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，BiomedicalInformatics，聚类，DifferentialExpression，ExonArray，FeatureExtraction，GeneExpression，MicroRNAArray，微阵列，MultipleComparison，蛋白质组学，RNASeq，测序，软件，转录，转录组，mRNAMicroarray |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，AnnotationDbi，BiocParallel，SummarizedExperiment，limma |
| 进口 | 统计数据、方法ggplot2，外国、图形、BiocStyle，Biobase，集群，gplots，RColorBrewer，locfit，made4，ade4，sfsmisc，scatterplot3d，gdata， grDevices, utils，reshape2，gridExtra |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，curatedTCGAData，MultiAssayExperiment，Homo.sapiens |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/fjcamlab/deco |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | deco_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | deco_1.6.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | deco_1.6.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deco |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/deco |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/deco/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
