debCAM

DOI:10.18129 / B9.bioc.debCAM

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见debCAM．

混合物的凸分析反褶积

Bioconductor版本:3.12

一个R包完全无监督的复杂组织反褶积。它提供了利用CAM对混合表达谱进行无监督反褶积的基本函数和一些辅助函数，以帮助理解亚群体特异性结果。它还实现了基于分子标记、S矩阵或A矩阵的先验知识进行监督反褶积的功能。结合来自CAM和先验知识的分子标记可以实现混合物的半监督反褶积。

作者:陈璐璐

维护人员:Lulu Chen

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("debCAM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“debCAM”)

超文本标记语言	R脚本	debCAM用户手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，GeneExpression，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)
进口	方法,rJava，BiocParallel统计数据,Biobase，SummarizedExperiment，corpcor，几何，NMF，nnlsDMwR,pcaPP，apcluster、图形
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，testthat，GEOquery，rgl
SystemRequirements	Java (>= 1.8)
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Lululuella/debCAM/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	debCAM_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	debCAM_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	debCAM_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/debCAM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/debCAM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/debCAM/
软件包下载报告	下载数据