ddPCRclust

DOI:10.18129 / B9.bioc.ddPCRclust

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ddPCRclust

ddPCR数据的聚类算法

Bioconductor版本:3.12

ddPCRclust算法可以自动定量多达四个目标的非正交ddPCR反应的cpd。为了确定每个目标的正确液滴数,关键是要识别所有簇,并根据它们的位置正确标记它们。有关可以分析哪些数据以及模板需要如何格式化的更多信息,请查看小插图。

作者:Benedikt G. Brink [aut, cre], Justin Meskas [ctb], Ryan R. Brinkman [ctb]

维护者:Benedikt G. Brink

引文(从R内,输入引用(“ddPCRclust”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ddPCRclust")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ddPCRclust”)

PDF R脚本 生物导体乳胶风格
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类软件ddPCR
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5)
进口 plotrix线索平行,ggplot2openxlsxR.utilsflowCoreflowDensity(> = 1.13.3),SamSPECTRALflowPeaks
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/bgbrink/ddPCRclust
BugReports https://github.com/bgbrink/ddPCRclust/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ddPCRclust_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 ddPCRclust_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ddPCRclust_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ddPCRclust
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ddPCRclust
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ddPCRclust/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网