cytofast

DOI:10.18129 / B9.bioc.cytofast

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cytofast．

一个用于CyTOF数据的快速可视化和分析工具

Bioconductor版本:3.12

多参数流式和大规模细胞术可以对免疫系统的细胞组成进行高分辨率的探索。结合FlowSOM和Cytosplore等工具，可以识别新的细胞类型。通过引入细胞快酶，我们希望为细胞簇的可视化和量化提供一个工作流程，以便有效地发现与疾病或其他临床结果相关的细胞群。

作者:K.A. Stam [aut, cre]， G. Beyrend [aut]

维护者:K.A. Stam < K.A.。Stam在hotmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cytofast")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cytofast”)

超文本标记语言	R脚本	斯皮策
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，FlowCytometry，软件，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	flowCore，ggplot2，ggridges，RColorBrewer，reshape2，统计，grDevices，Rdpack，方法，网格，FlowSOM
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cytofast_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	cytofast_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cytofast_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytofast
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cytofast
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cytofast/
软件包下载报告	下载数据