腰带

DOI:10.18129 / B9.bioc.cummeRbund

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见腰带

袖扣高通量测序数据的分析、探索、操作和可视化。

Bioconductor版本:3.12

允许持久存储,访问,探索,和操作袖扣高通量测序数据。此外,还为常用的可视化提供了许多绘图函数。

作者:L.戈夫,C.特拉普内尔,D.凯利

维护者:Loyal A. Goff

引文(从R内,输入引用(腰带)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cummeRbund")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(腰带)

PDF R脚本 CummeRbund用户指南
PDF R脚本 示例腰带工作流程
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学聚类DataImportDataRepresentationDifferentialExpressionGeneExpressionHighThroughputSequencingHighThroughputSequencingData基础设施MultipleComparisons质量控制RNAseqRNAseqData软件可视化
版本 2.32.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.7.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),RSQLiteggplot2reshape2fastclusterrtracklayerGviz
进口 方法,plyrBiocGenericsS4Vectors(> = 0.9.25),Biobase
链接
建议 集群plyrNMFNstringrGenomicFeaturesGenomicRangesrjson
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 meshr
建议我 IsoformSwitchAnalyzeR
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 cummeRbund_2.32.0.tar.gz
Windows二进制 cummeRbund_2.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) cummeRbund_2.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cummeRbund
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cummeRbund
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cummeRbund/
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