cqn

DOI:10.18129 / B9.bioc.cqn

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cqn。

条件分位数正常化

Bioconductor版本:3.12

标准化工具RNA-Seq数据,实现条件分位数归一化法。

作者:琼(织金)吴Kasper丹尼尔·汉森

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cqn”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cqn”)

PDF	R脚本	CQN条件分位数(归一化)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,预处理,RNASeq,软件
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10.0),mclust,nor1mix统计数据,preprocessCore样条函数,quantreg
进口	样条函数
链接
建议	尺度,刨边机
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	exomePeak2,KnowSeq
进口我	tweeDEseq
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cqn_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	cqn_1.36.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	cqn_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cqn
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cqn
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cqn/
包下载报告	下载数据