cosmiq

DOI:10.18129 / B9.bioc.cosmiq

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cosmiq

cosmiq——结合单质量数量

Bioconductor版本:3.12

cosmiq预处理是一种工具的液体或气体,色谱质谱(LCMS / GCMS)数据集中在代谢组学或lipidomics应用程序。改善低丰富的信号检测,cosmiq生成主地图mZ / RT空间的所有获得运行前峰值检测算法。结果是一个更健壮的女士低强度信号的识别和量化相比,传统的方法挑选峰值分别在每个LCMS /模型文件执行。cosmiq包构建在xcmsSet对象结构,因此可以集成与包xcms作为替代预处理步骤。

作者:大卫•费舍尔(aut (cre)基督教Panse (aut),Endre Laczko(施)

维护人员:大卫费舍尔< dajofischer googlemail.com >

从内部引用(R,回车引用(“cosmiq”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cosmiq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cosmiq”)

PDF R脚本 cosmiq底漆
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(6.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.6),Rcpp
进口 pracma,xcms,MassSpecWavelet,faahKO
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 cosmiq_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 cosmiq_1.24.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) cosmiq_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cosmiq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/
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