这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cosmiq。
Bioconductor版本:3.12
cosmiq预处理是一种工具的液体或气体,色谱质谱(LCMS / GCMS)数据集中在代谢组学或lipidomics应用程序。改善低丰富的信号检测,cosmiq生成主地图mZ / RT空间的所有获得运行前峰值检测算法。结果是一个更健壮的女士低强度信号的识别和量化相比,传统的方法挑选峰值分别在每个LCMS /模型文件执行。cosmiq包构建在xcmsSet对象结构,因此可以集成与包xcms作为替代预处理步骤。
作者:大卫•费舍尔(aut (cre)基督教Panse (aut),Endre Laczko(施)
维护人员:大卫费舍尔< dajofischer googlemail.com >
从内部引用(R,回车引用(“cosmiq”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cosmiq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“cosmiq”)
R脚本 | cosmiq底漆 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.24.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(6.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.6),Rcpp |
进口 | pracma,xcms,MassSpecWavelet,faahKO |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | cosmiq_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | cosmiq_1.24.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | cosmiq_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cosmiq |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/ |
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