coseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.coseq

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见coseq

测序数据的共表达分析

Bioconductor版本:3.12

高通量测序数据中表达谱的共表达分析。使用自适应转换和混合模型或K-means算法对特征(例如基因)轮廓进行聚类,并提供模型选择标准(选择适当数量的聚类)。

作者:Andrea Rau, Cathy Maugis-Rabusseau, Antoine godichonbaggioni

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>

引文(从R内,输入引用(“coseq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("coseq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“coseq”)

超文本标记语言 R脚本 coseq
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionImmunoOncologyRNASeq测序软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (>= 3.4.0),SummarizedExperimentS4Vectors
进口 刨边机DESeq2capusheRmixmode1071BiocParallelggplot2(> =魅惑,尺度HTSFiltercorrplotHTSCluster(>= 2.0.8), grDevices,图形,统计,方法,作文mvtnorm
链接
建议 Biobaseknitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 coseq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 coseq_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) coseq_1.14.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coseq
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/coseq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/coseq/
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