consensusSeekeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.consensusSeekeR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见consensusSeekeR．

使用基因组位置和基因组范围检测一组经验中的共识区域

Bioconductor版本:3.12

该软件包从多个实验中比较基因组位置和基因组范围，以提取共同区域。所分析区域的大小是可调的，并且经验的数量是可调的，其中一个特征必须出现在一个潜在的区域中，才能将该区域标记为共识区域。

作者:Astrid Deschenes [cre, aut]， Fabien Claude Lamaze [ctb]， Pascal Belleau [aut]， Arnaud Droit [aut]

维护者:Astrid Deschenes

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("consensusSeekeR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“consensusSeekeR”)

超文本标记语言	R脚本	一组实验中一致性区域的检测
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion，ChIPSeq，报道，遗传学，MultipleComparison，PeakDetection，测序，软件，转录
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10)，BiocGenerics，IRanges，GenomicRanges，BiocParallel
进口	GenomeInfoDb，rtracklayer，stringr，S4Vectors、方法
链接
建议	BiocStyle，ggplot2，knitr，rmarkdown，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/ArnaudDroitLab/consensusSeekeR
BugReports	https://github.com/ArnaudDroitLab/consensusSeekeR/issues
全靠我
进口我	RJMCMCNucleosomes
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	consensusSeekeR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	consensusSeekeR_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	consensusSeekeR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/consensusSeekeR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/consensusSeekeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/consensusSeekeR/
软件包下载报告	下载数据