该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅carpartmap。
生物导体版本:3.12
Carcartmap从ATAC-SEQ和甲基化阵列中进行缩小的A/B车厢推断。
作者:本杰明·约翰逊[AUT,CRE],Tim Triche [AUT],Kasper Hansen [aut],Jean-Philippe Fortin [aut]
维护者:本杰明·约翰逊(Benjamin Johnson)
引用(从r内,输入引用(“ carcartmap”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ carpartmap”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ carcartmap”)
html | R脚本 | A/B车厢推理带有car虫 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | Atacseq,,,,表观遗传学,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(2。5年) |
执照 | GPL-3 +文件执照 |
要看 | r(> = 3.5.0),Minfi,,,,同性恋,,,,混合学 |
进口 | 总结性特征,,,,基因组机,,,,gtools, 平行 |
链接 | |
建议 | COVR,,,,测试,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/biobenkj/compartmap |
BugReports | https://github.com/biobenkj/compartmap/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cartmap_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | cartmap_1.8.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | cartmap_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compartmap |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/carbartmap |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/compartmap/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |