carpartmap

doi:10.18129/b9.bioc.compartmap

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅carpartmap

来自ATAC-SEQ和甲基化阵列数据的A/B室推断

生物导体版本:3.12

Carcartmap从ATAC-SEQ和甲基化阵列中进行缩小的A/B车厢推断。

作者:本杰明·约翰逊[AUT,CRE],Tim Triche [AUT],Kasper Hansen [aut],Jean-Philippe Fortin [aut]

维护者:本杰明·约翰逊(Benjamin Johnson)

引用(从r内,输入引用(“ carcartmap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ carpartmap”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ carcartmap”)

html R脚本 A/B车厢推理带有car虫
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 Atacseq,,,,表观遗传学,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(2。5年)
执照 GPL-3 +文件执照
要看 r(> = 3.5.0),Minfi,,,,同性恋,,,,混合学
进口 总结性特征,,,,基因组机,,,,gtools, 平行
链接
建议 COVR,,,,测试,,,,尼特
系统要求
增强
URL https://github.com/biobenkj/compartmap
BugReports https://github.com/biobenkj/compartmap/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cartmap_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 cartmap_1.8.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) cartmap_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compartmap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/carbartmap
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/compartmap/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网