结合

DOI:10.18129 / B9.bioc.combi

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见结合

基于视觉整合的成分组学模型

Bioconductor版本:3.12

结合准似然估计、复合回归模型和潜变量模型,对多个组学数据集进行综合可视化。无约束和有约束积分均可用,结果显示为可解释的多图。

作者:Stijn Hawinkel < Stijn。Hawinkel在ugent, be>

维护者:Joris Meys < Joris。Meys at ugent.be>

引文(从R内,输入引用(“联合”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("combi")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“联合”)

超文本标记语言 R脚本 combi包手册
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DimensionReduction代谢组学宏基因组微生物组软件可视化
版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 ggplot2nleqslvphyloseq张量统计数据,limma矩阵BBreshape2阿拉巴马州玉米穗轴Biobase素食主义者, grDevices,图形,方法,SummarizedExperiment
链接
建议 knitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/CenterForStatistics-UGent/combi/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 combi_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 combi_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) combi_1.2.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/combi
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/combi
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/combi/
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