cnvGSA

DOI:10.18129 / B9.bioc.cnvGSA

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cnvGSA．

(罕见)拷贝数变异的基因集分析

Bioconductor版本:3.12

该包旨在促进病例对照研究中罕见CNVs的基因集关联。

作者:Daniele Merico < Daniele。merico在gmail.com>， Robert Ziman ;由约瑟夫·卢戈包装。Lugo在gmail.com>

维护者:Joseph Lugo < Joseph .r.;Lugo在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cnvGSA")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cnvGSA”)

PDF		稀有拷贝数变异的基因集分析
PDF		cnvGSAUsersGuide.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	MultipleComparison，软件
版本	1.34.0
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(9年)
许可证	LGPL
取决于	brglm，doParallel，foreach，GenomicRanges、方法、splitstackshape
进口
链接
建议	cnvGSAdata，org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	cnvGSAdata
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cnvGSA_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	cnvGSA_1.34.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cnvGSA_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnvGSA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cnvGSA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cnvGSA/
软件包下载报告	下载数据