cmapr

doi:10.18129/b9.bioc.cmapr

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅cmapr

r中的cmap工具

生物导体版本:3.12

连接图(CMAP)是Broad Institute研究人员建立的扰动基因表达概况的大量资源,并由NIH基于网络的基于网络的蜂窝签名(LINCS)计划资助。有关更多信息,请访问https://clue.io。CMAPR软件包实现了解析,操纵和编写通用CMAP数据对象的方法,例如注释的基因和基因集的集合。

作者:Ted Natoli [AUT,CRE]

维护者:ted natoli

引用(从r内,输入引用(“ CMAPR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ cmapr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cmapr”)

html R脚本 CMAPR教程
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,基因表达,,,,软件
版本 1.2.1
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 文件执照
要看 R(> = 4.0)
进口 方法,RHDF5,,,,Data.Table,,,,流核,,,,总结性特征,,,,矩阵
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/cmap/cmapr
BugReports https://github.com/cmap/cmapr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cmapr_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 cmapr_1.2.1.zip
MacOS 10.13(高山脉) cmapr_1.2.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cmapr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cmapr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cmapr/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网