该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅清理。
生物导体版本:3.12
该软件包实现了幼稚的贝叶斯分类器,以准确鉴定基于寡核的3个质子末端测序(例如Pas-Seq,Polya-Seq和RNA-Seq)的聚腺苷酸化位点(PA位点)。分类器高度准确,胜过启发式方法。
作者:Sarah Sheppard,Jianhong OU,Nathan Lawson,Lihua Julie Zhu
维护者:jianhong ou
引用(从r内,输入引用(“清理”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ clearupdtseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ clearupdtseq”)
html | R脚本 | Clearupdtseq小插图 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结肠管制,,,,遗传学,,,,测序,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.28.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(7。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.5.0),生物基因(> = 0.1.0),方法,统计 |
进口 | BSGENOME,,,,基因组机,,,,seqinr,,,,E1071,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,utils,BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER7 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,运行 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | inpas |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Clearupdtseq_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | clearupdtseq_1.28.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Clearupdtseq_1.28.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cleanupdtseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/callupdtseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cleanupdtseq/ |
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