清理

doi:10.18129/b9.bioc.cleanupdtseq

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅清理

该软件包将推定的聚烯基化位点分类为真或错误/内部寡素化站点

生物导体版本:3.12

该软件包实现了幼稚的贝叶斯分类器,以准确鉴定基于寡核的3个质子末端测序(例如Pas-Seq,Polya-Seq和RNA-Seq)的聚腺苷酸化位点(PA位点)。分类器高度准确,胜过启发式方法。

作者:Sarah Sheppard,Jianhong OU,Nathan Lawson,Lihua Julie Zhu

维护者:jianhong ou ;Lihua Julie Zhu

引用(从r内,输入引用(“清理”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ clearupdtseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ clearupdtseq”)

html R脚本 Clearupdtseq小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结肠管制,,,,遗传学,,,,测序,,,,测序,,,,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(7。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.5.0),生物基因(> = 0.1.0),方法,统计
进口 BSGENOME,,,,基因组机,,,,seqinr,,,,E1071,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,utils,BSGENOME.DRERIO.UCSC.DANRER7
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,运行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 inpas
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Clearupdtseq_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 clearupdtseq_1.28.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Clearupdtseq_1.28.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cleanupdtseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/callupdtseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cleanupdtseq/
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