此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见chimeraviz.
Bioconductor版本:3.12
Chimeraviz管理来自融合基因发现者的数据,并提供有用的可视化工具。
作者:Stian Lågstad [aut, cre], Sen Zhao [ctb], Andreas M. Hoff [ctb], Bjarne Johannessen [ctb], Ole Christian Lingjærde [ctb], Rolf Skotheim [ctb]
维护者:Stian Lågstad
引文(从R内,输入引用(“chimeraviz”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("chimeraviz")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“chimeraviz”)
超文本标记语言 | R脚本 | chimeraviz |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 对齐,基础设施,软件 |
版本 | 1.16.1 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(4年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,Gviz,S4Vectors,ensembldb,AnnotationFilter,data.table |
进口 | 方法、网格Rsamtools,GenomeInfoDb,GenomicAlignments,RColorBrewer、图形、AnnotationDbi,RCircos,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,rmarkdown,图,Rgraphviz,DT,plyr,dplyr,BiocStyleArgumentCheck,gtools,魔法 |
链接 | |
建议 | testthat,roxygen2,devtools,knitr,lintr |
SystemRequirements | 有些功能需要Bowtie、samtools和egrep |
增强了 | |
URL | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz |
BugReports | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | chimeraviz_1.16.1.tar.gz |
Windows二进制 | chimeraviz_1.16.1.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | chimeraviz_1.16.1.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chimeraviz |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/ |
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