cfDNAPro

DOI:10.18129 / B9.bioc.cfDNAPro

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cfDNAPro．

该软件包有助于从液体活检中表征和可视化全基因组测序数据

Bioconductor版本:3.12

cfDNA片段大小指标是利用液体活检进行肿瘤早期检测、诊断、个性化治疗和监测的重要特征。分析和可视化插入大小指标可能需要大量时间。这个包旨在简化这个探索过程，它提供了两组用于数据描述和数据可视化的函数。

作者:王海超[aut, cre]，赵辉[ctb]， Christopher Smith [ctb]

维护者:王海超

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cfDNAPro")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cfDNAPro”)

超文本标记语言	R脚本	cfDNAPro教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	测序，软件，可视化，WholeGenome
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)，magrittr(> = 1.5.0)
进口	属性,跑龙套,dplyr(> = 0.8.3),stringr(> = 1.4.0),quantmod(> = 0.4),ggplot2(> = 3.2.1),Rsamtools(> =测试盒框),rlang(> = 0.4.0)
链接
建议	尺度，ggpubr，knitr(> = 1.23),rmarkdown(> = 1.14),devtools(> = tripwire),BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hw538/cfDNAPro
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cfDNAPro_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	cfDNAPro_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cfDNAPro_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cfDNAPro
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cfDNAPro
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cfDNAPro/
软件包下载报告	下载数据