cellity

DOI:10.18129 / B9.bioc.cellity

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cellity．

单细胞rna序列数据的质量控制

Bioconductor版本:3.12

支持向量机方法识别和过滤低质量细胞从单细胞RNA-seq数据集。

作者:Tomislav Illicic, Davis McCarthy

维护者:Tomislav Ilicic

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("cellity")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cellity”)

超文本标记语言	R脚本	介绍cellity包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，预处理，质量控制，RNASeq，测序，软件，SupportVectorMachine，转录组，可视化
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.3)
进口	AnnotationDbi，e1071，ggplot2，图形，grDevices，网格，mvoutlier，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，robustbase统计数据,topGO,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，脱字符号，knitr，testthat，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cellity_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	cellity_1.18.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cellity_1.18.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cellity
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cellity
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cellity/
软件包下载报告	下载数据