CCREPE
doi：10.18129/b9.bioc.ccrepe
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅CCREPE。
ccrepe_and_nc.score
生物导体版本：3.12
CCREPE（由肾上腺素化和排列校正的组成性）旨在评估组成数据集中一般相似性度量的重要性。例如，在微生物丰度数据中，所有微生物的总丰度总和为一个。CCREPE旨在在将P值分配给微生物之间的相似性度量时考虑此约束。该软件包具有两个函数：CCREPE：计算使用引导程序和数据的置换矩阵在一个或两个身体位点相对丰度的相似性度量，p值和Q值。NC.Score：根据棋盘得分扩展到序数数据，计算物种级的共同变异和共排除模式。
作者：Emma Schwager
维护者：gmail.com>> emma schwager
引用（从r内，输入引用（“ ccrepe”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ ccrepe”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ ccrepe”）
| R脚本 | CCREPE | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 生物信息学，，，，免疫学，，，，宏基因组学，，，，软件，，，，统计数据 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（7年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | |
| 进口 | 信息（> = 1.1） |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，生物使用，，，，生物基因，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ccrepe_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ccrepe_1.26.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | ccrepe_1.26.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ccrepe |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ccrepe |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ccrepe/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
