cbaf

DOI:10.18129 / B9.bioc.cbaf

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见cbaf

自动比较来自cbioportal.org的各种omic数据的功能

Bioconductor版本:3.12

该软件包包含的功能可以方便地分析和比较各种癌症/癌症亚组的组学数据。到目前为止,它与存储在cbioportal.org上的RNA-seq, microRNA-seq,微阵列和甲基化数据集兼容。

作者:Arman Shahrisa [aut, cre, cph], Maryam Tahmasebi Birgani [aut]

维护者:Arman Shahrisa < Shahrisa。Arman在hotmail.com>

引文(从R内,输入引用(“cbaf”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cbaf")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cbaf”)

超文本标记语言 R脚本 cbaf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AssayDomainBiomedicalInformaticsComparativeGenomicsDNAMethylation表观遗传学GeneExpression遗传学ResearchField软件转录转录组
版本 1.12.1
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5.0)
进口 BiocFileCacheRColorBrewercgdsrgenefiltergplots, grDevices, stats, utils,xlsx
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 cbaf_1.12.1.tar.gz
Windows二进制 cbaf_1.12.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra) cbaf_1.12.1.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cbaf
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cbaf/
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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网