此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见癌症.
Bioconductor版本:3.12
该包是基于cgdsr和其他建模包的用户友好界面,用于探索、比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化、基因表达、蛋白质磷酸化、拷贝数改变),由Memorial-Sloan-Kettering癌症中心(MSKCC)的计算生物学中心托管。
作者:Karim Mezhoud。核安全保障部。突尼斯核科学中心。
维护者:Karim Mezhoud
引文(从R内,输入引用(“癌症”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("canceR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GUI,GeneExpression,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.4), tcltktcltk2,cgdsr |
进口 | GSEABase,tkrplot,geNetClassifier,RUnit,公式,rpart,生存,Biobase,phenoTest,circlize,plyr,图形,统计,utils, grDevices |
链接 | |
建议 | testthat(> = 0.10.0),R.rsp |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | canceR_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | canceR_1.24.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | canceR_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/canceR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/canceR/ |
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