癌症

DOI:10.18129 / B9.bioc.canceR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见癌症

用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面

Bioconductor版本:3.12

该包是基于cgdsr和其他建模包的用户友好界面,用于探索、比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化、基因表达、蛋白质磷酸化、拷贝数改变),由Memorial-Sloan-Kettering癌症中心(MSKCC)的计算生物学中心托管。

作者:Karim Mezhoud。核安全保障部。突尼斯核科学中心。

维护者:Karim Mezhoud

引文(从R内,输入引用(“癌症”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("canceR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GUIGeneExpression软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.4), tcltktcltk2cgdsr
进口 GSEABasetkrplotgeNetClassifierRUnit公式rpart生存BiobasephenoTestcirclizeplyr,图形,统计,utils, grDevices
链接
建议 testthat(> = 0.10.0),R.rsp
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 canceR_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 canceR_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) canceR_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/canceR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/canceR/
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