cBioPortalData

DOI:10.18129 / B9.bioc.cBioPortalData

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见cBioPortalData．

暴露并提供来自cBioPortal web资源的数据

Bioconductor版本:3.12

cBioPortalData包从存储库(如cBioPortal)获取压缩资源，并将MultiAssayExperiment对象与Bioconductor类组装在一起。

作者:Levi Waldron [aut]， Marcel Ramos [aut, cre]

维护者:Marcel Ramos < Marcel。Ramos在roswellpark.org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cBioPortalData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cBioPortalData”)

超文本标记语言	R脚本	cBioPortal快速入门指南
超文本标记语言	R脚本	cBioPortal用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	基础设施，软件，ThirdPartyClient
版本	. 2.2.11
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	AGPL-3
取决于	R (>= 4.0.0)，铁砧，MultiAssayExperiment
进口	BiocFileCache(> = 1.5.3)更正,消化，dplyr，GenomeInfoDb，GenomicRanges，httr，IRanges、方法、readr，RaggedExperiment，RTCGAToolbox(> = 2.19.7),S4Vectors，SummarizedExperiment统计数据,宠物猫，tidyr，TCGAutils(>= 1.9.4)， utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/waldronlab/cBioPortalData/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cBioPortalData_2.2.11.tar.gz
Windows二进制	cBioPortalData_2.2.11.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	cBioPortalData_2.2.11.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cBioPortalData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cBioPortalData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cBioPortalData/
软件包下载报告	下载数据