breakpointR

DOI:10.18129 / B9.bioc.breakpointR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见breakpointR．

在Strand-seq数据中查找断点

Bioconductor版本:3.12

这个包实现了查找断点、绘制和导出Strand-seq数据的功能。

作者:David Porubsky, Ashley Sanders, Aaron Taudt

维护者:David Porubsky < David。Porubsky在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“breakpointR”)

PDF	R脚本	如何使用breakpointR
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	报道，DNASeq，测序，SingleCell，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 3.5)，GenomicRanges，cowplot，breakpointRdata
进口	方法，utils, grDevices, stats，S4Vectors，GenomeInfoDb(> = 1.12.3),IRanges，Rsamtools，GenomicAlignments，ggplot2，BiocGenerics，gtools，doParallel，foreach
链接
建议	knitr，BiocStyle，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/daewoooo/BreakPointR
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	breakpointR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	breakpointR_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	breakpointR_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/breakpointR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/breakpointR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/breakpointR/
软件包下载报告	下载数据