分歧点

DOI:10.18129 / B9.bioc.branchpointer

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见分歧点．

内含子剪接分支点的预测

Bioconductor版本:3.12

预测内含子分支窗口中站点的分支点概率。查询可以作为内含子区域提供;或者评估突变的影响，snp。

作者:贝丝信号

维护器:贝丝信号

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("branchpointer")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“分歧点”)

PDF	R脚本	使用分支指针注释内含子人体拼接分支点
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GenomeAnnotation，GenomicVariation，MotifAnnotation，软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	脱字符号， r (>= 3.4)
进口	plyr，kernlab，“绿带运动”，stringr，cowplot，ggplot2，biomaRt，Biostrings，并行，utils，统计，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，rtracklayer，GenomicRanges，GenomeInfoDb，IRanges，S4Vectors，data.table
链接
建议	knitr，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	branchpointer_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	branchpointer_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	branchpointer_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/分歧点
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/
包下载报告	下载数据