咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见咆哮

生物导体的聚类算法

Bioconductor版本:3.12

将常见的聚类算法封装在易于扩展的S4框架中。后端实现了分层、k-means和基于图的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“咆哮”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“咆哮”)

超文本标记语言 R脚本 1.聚类算法
超文本标记语言 R脚本 2.聚类诊断
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类GeneExpressionImmunoOncologySingleCell软件转录组
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 统计,方法,效用,矩阵RcppigraphS4VectorsBiocParallelBiocNeighbors
链接 Rcpp
建议 knitrrmarkdowntestthatBiocStyledynamicTreeCutscRNAseq天窗食物pheatmap冬青
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
全靠我
进口我 mbkmeansscDblFinder食物
建议我 后面;scDblFinder
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 bluster_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 bluster_1.0.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) bluster_1.0.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bluster
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bluster/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网