Blima
doi：10.18129/b9.bioc.blima
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅Blima。
用于对探测器（珠）水平的Illumina微阵列进行预处理和分析的工具
生物导体版本：3.12
软件包Blima包括几种用于预处理Illumina微阵列数据的算法。它集中在珠级分析上，并为不等长度的向量的分位归一化提供了新的方法。它提供了多种背景校正方法，包括背景减法，RMA（例如卷积和背景离群）的去除。它还在珠子水平上实现方差稳定转换。也有实施的数据摘要方法。它还提供了在检测器（珠）水平上执行t检验的方法以及用于差异表达测试的探针水平。
作者：vojtěchkulvait
维护者：vojtěchkulvait
引用（从r内，输入引用（“ Blima”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ blima”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Blima”）
| R脚本 | Blima.pdf | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，微阵列，，，，正常化，，，，预处理，，，，软件 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.3） |
| 进口 | Beadarray（> = 2.0.0），生物酶（> = 2.0.0），RCPP（> = 0.12.8），生物基因，grdevices，统计，图形 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | Xtable，，，，blimatestingdata，，，，生物使用，，，，Illuminahumanv4.db，，，，Lumi，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://bitbucket.org/kulvait/blima |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | blimatestingdata |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Blima_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | blima_1.24.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | Blima_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blima |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/blima |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/blima/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
