此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见blacksheepr.
Bioconductor版本:3.12
Blacksheep是一种用于两两比较背景下的离群值分析的工具,旨在发现两个组之间的区别特征。该工具被设计用于生物应用,如磷蛋白组学或转录组学,但它可以用于任何可以用2D表表示的数据,并且在表中有两个亚种群进行比较。
作者:MacIntosh Cornwell [aut], RugglesLab [cre]
维护:RugglesLab < RugglesLab at gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“blacksheepr”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("blacksheep ")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“blacksheepr”)
超文本标记语言 | R脚本 | 用黑羊磷蛋白进行离群分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,RNASeq,测序,软件,转录,转录组 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | grid, stats, grDevices, utils,circlize,冬青,RColorBrewer,ComplexHeatmap,SummarizedExperiment,pasilla |
链接 | |
建议 | testthat(> =魅惑,knitr,BiocStyle,rmarkdown,旋度 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/ruggleslab/blackSheepR/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | blacksheepr_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | blacksheepr_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | blacksheepr_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/blacksheepr |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/blacksheepr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/blacksheepr/ |
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