Biovizbase
doi：10.18129/b9.bioc.biovizbase
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅Biovizbase。
可视化基因组数据的基本图形实用程序。
生物导体版本：3.12
BiovizBase软件包旨在为基因组数据提供一组实用程序，配色方案和约定。它是用于生物数据可视化的各种高级包装的基础。这节省了发展努力并鼓励一致性。
作者：Tengfei Yin [AUT]，Michael Lawrence [AUT，THS，CRE]，Dianne Cook [AUT，THS]，Johannes Rainer [CTB]
维护者：迈克尔·劳伦斯（Michael Lawrence）
引用（从r内，输入引用（“ Biovizbase”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ biovizbase”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Biovizbase”）
| R脚本 | Biovizbase简介 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基础设施，，，，预处理，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 1.38.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（9。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.5.0），方法 |
| 进口 | grdevices，统计秤，，，，HMISC，，，，rcolorbrewer，，，，Dichromat，，，，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.23.19），iranges（> = 1.99.28），GenomeInfodB（> = 1.5.14），基因组机（> = 1.23.21），总结性特征，，，，生物弦（> = 2.33.11），rsamtools（> = 1.17.28），基因组签名（> = 1.1.16），GenomicFeatures（> = 1.21.19），AnnotationDbi，，，，变体（> = 1.11.4），Ensembldb（> = 1.99.13），AnnotationFilter（> = 0.99.8），rlang |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，BSGENOME，，，，rtracklayer，，，，ensdb.hsapiens.v75，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | 咖啡店，，，，QRQC |
| 进口我 | 气泡，，，，chipexoqual，，，，GGBIO，，，，GVIZ，，，，核粒子，，，，PVIZ，，，，QRQC，，，，RQC |
| 建议我 | Cindex，，，，derfinderplot，，，，R3CPET，，，，地区报告，，，，结构视频隔离，，，，txreginfra |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | biovizbase_1.38.0.tar.gz |
| Windows二进制 | biovizbase_1.38.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | biovizbase_1.38.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biovizbase |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/biovizbase |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/biovizbase/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
