bioCancer

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioCancer

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅bioCancer。

交互式Multi-Omics癌症数据可视化和分析

Bioconductor版本:3.12

bioCancer是一个闪亮的应用可视化和分析交互式Multi-Assays癌症基因组数据。

作者:卡里姆Mezhoud (aut (cre)

维护人员:卡里姆Mezhoud < kmezhoud gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bioCancer”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“bioCancer”)

HTML	R脚本	bioCancer:互动Multi-OMICS癌症数据可视化和分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation,GUI,GeneExpression,GeneTarget,MultipleComparison,网络,通路,Reactome,软件,可视化
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	AGPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0),radiant.data(> = 1.0.6),cgdsr(> =)相对于1.2.6,XML(> = 3.99)
进口	闪亮的(> = 1.0.5),AlgDesign(> = 1.1.7.3),进口(> = 1.1.0)、方法shinythemes,Biobase,geNetClassifier,AnnotationFuncs,org.Hs.eg.db,剂量,clusterProfiler,reactome.db,ReactomePA,图(> = 1.0.5),visNetwork,htmlwidgets,plyr,宠物猫,DT(> = 0.12),dplyr(> = 0.8.5)
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown,knitr,testthat(> = 0.10.0)
SystemRequirements
增强了
URL	http://kmezhoud.github.io/bioCancer
BugReports	https://github.com/kmezhoud/bioCancer/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bioCancer_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	bioCancer_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	bioCancer_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioCancer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bioCancer
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bioCancer/
包下载报告	下载数据