bigmelon

DOI:10.18129 / B9.bioc.bigmelon

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅bigmelon。

Illumina公司甲基化数组分析大型实验

Bioconductor版本:3.12

方法使用Illumina公司使用gdsfmt数组。

作者:泰勒j . Gorrie-Stone (cre, aut) Ayden Saffari (aut),卡里姆Malki (aut),伦纳德·c·Schalkwyk (aut)

维护人员:泰勒j . Gorrie-Stone <泰勒。在diamond.ac.uk gorrie-stone >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bigmelon”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“bigmelon”)

PDF	R脚本	bigmelon包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CpGIsland,DNAMethylation,DataImport,MethylationArray,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3),西瓜(> = 1.25.0),gdsfmt(> = 1.0.4)、方法minfi(> = 1.21.0),Biobase,methylumi
进口	属性,跑龙套,GEOquery、图形、BiocGenerics
链接
建议	BiocGenerics,RUnit,BiocStyle,minfiData平行,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,bumphunter
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	bigmelon_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	bigmelon_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	bigmelon_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bigmelon
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bigmelon
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/bigmelon/
包下载报告	下载数据