beachmat

DOI:10.18129 / B9.bioc.beachmat

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅beachmat。

编译Bioconductor处理每个矩阵类型

Bioconductor版本:3.12

提供了一个一致的c++类接口读取和写入数据,选用多种常用的矩阵类型。普通矩阵和稀疏的几个/稠密矩阵类直接支持,第三方S4类可能是由外部链接,而所有其他矩阵是由DelayedArray块处理。

作者:亚伦Lun (aut (cre), Herve页(aut),迈克·史密斯(aut)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“beachmat”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“beachmat”)

HTML	R脚本	1。开发人员指南
HTML	R脚本	2。读取数据从R矩阵在c++中(v2)
HTML	R脚本	3所示。写数据到R矩阵对象(v2)
HTML	R脚本	4所示。支持任意的矩阵类(v2)
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件
版本	2.6.4
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics,矩阵
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,rcmdcheck,BiocParallel
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
取决于我
进口我	BiocSingular,DropletUtils,食物,天窗,单
建议我	bsseq,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,scCB2,TSCAN
我的链接	BiocSingular,bsseq,DropletUtils,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,食物,天窗,单
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	beachmat_2.6.4.tar.gz
Windows二进制	beachmat_2.6.4.zip
macOS 10.13(高山脉)	beachmat_2.6.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ beachmat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/beachmat/
包下载报告	下载数据