baySeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.baySeq

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见baySeq．

计数数据中差异表达模式的经验贝叶斯分析

Bioconductor版本:3.12

该软件包识别高通量“计数”数据中的差异表达，例如来自下一代测序机的数据，通过经验贝叶斯方法计算差异表达(或更复杂的假设)的估计后验可能性。

作者:Thomas J. Hardcastle

维护者:Thomas J. Hardcastle

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("baySeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“baySeq”)

PDF	R脚本	高级baySeq分析
PDF	R脚本	baySeq
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，MultipleComparison，圣人，测序，软件
版本	2.24.0
在Bioconductor	BioC 2.5 (R-2.10)(11.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 2.3.0)，方法，GenomicRanges，abind、并行
进口	刨边机
链接
建议	BiocStyle，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	clusterSeq，埃达，Rcade，segmentSeq，移行细胞癌
进口我	埃达，metaseqR，metaseqR2，riboSeqR
建议我	compcodeR
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	baySeq_2.24.0.tar.gz
Windows二进制	baySeq_2.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	baySeq_2.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/baySeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/baySeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/baySeq/
软件包下载报告	下载数据