舞会礼服

DOI:10.18129 / B9.bioc.ballgown

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见舞会礼服．

灵活的，异构体水平的差异表达分析

Bioconductor版本:3.12

组合转录组的统计分析工具，包括灵活的差异表达分析，转录本结构的可视化，以及组合转录本与注释的匹配。

作者:Jack Fu [aut]， Alyssa C. Frazee [aut, cre]， Leonardo Collado-Torres [aut]， Andrew E. Jaffe [aut]， Jeffrey T. Leek [aut, ths]

维护者:Jack Fu

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" ballrobe ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“舞会礼服”)

超文本标记语言	R脚本	用Ballgown进行灵活的异构体水平差异表达分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，ImmunoOncology，预处理，RNASeq，软件，StatisticalMethod
版本	2.22.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.1.1)，方法
进口	GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.9.39),RColorBrewer样条函数,股东价值分析，limma，rtracklayer(> = 1.29.25),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb
链接
建议	testthat，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues
全靠我	vasp，VaSP
进口我	RNASeqR
建议我	聚酯，variancePartition
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ballgown_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	ballgown_2.22.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ballgown_2.22.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ballgown
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/
软件包下载报告	下载数据