此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见培根.
Bioconductor版本:3.12
培根可以用来去除在表观基因组和转录组范围的关联研究中经常观察到的膨胀和偏倚。为此,培根使用吉布斯采样算法在z分数上拟合一个三分量正态混合来构造一个经验零分布。
作者:Maarten van Iterson [aut, cre], Erik van Zwet [ctb]
维护者:Maarten van Iterson
引文(从R内,输入引用(培根)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(培根)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用经验零分布控制关联研究中的偏倚和膨胀 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BatchEffect,贝叶斯,GenomeWideAssociation,ImmunoOncology,MethylationArray,MultipleComparison,RNASeq,回归,软件,StatisticalMethod,转录组 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.3),方法,统计,ggplot2、图形、BiocParallel,椭圆 |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,roxygen2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | bacon_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | bacon_1.18.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | bacon_1.18.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bacon |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bacon |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/bacon/ |
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