培根

DOI:10.18129 / B9.bioc.bacon

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见培根

使用经验零分布控制关联研究中的偏倚和膨胀

Bioconductor版本:3.12

培根可以用来去除在表观基因组和转录组范围的关联研究中经常观察到的膨胀和偏倚。为此,培根使用吉布斯采样算法在z分数上拟合一个三分量正态混合来构造一个经验零分布。

作者:Maarten van Iterson [aut, cre], Erik van Zwet [ctb]

维护者:Maarten van Iterson

引文(从R内,输入引用(培根)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

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超文本标记语言 R脚本 使用经验零分布控制关联研究中的偏倚和膨胀
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细节

biocViews BatchEffect贝叶斯GenomeWideAssociationImmunoOncologyMethylationArrayMultipleComparisonRNASeq回归软件StatisticalMethod转录组
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.3),方法,统计,ggplot2、图形、BiocParallel椭圆
进口
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建议 BiocStyleknitrrmarkdowntestthatroxygen2
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 bacon_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 bacon_1.18.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) bacon_1.18.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bacon
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bacon
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/bacon/
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