此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见吸引.
Bioconductor版本:3.12
此包包含查找代表Kauffman吸引子景观驱动程序的基因表达模块的函数。这些模块是区分感兴趣的不同细胞类型的核心吸引子通路。每个通路都有一组联合表达组,它们显示了基因表达的转录协调变化。
作者:Jessica Mar
维护者:Samuel Zimmerman < Samuel .e。齐默尔曼在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“吸引”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("吸引")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“吸引”)
R脚本 | 教程:如何使用\texttt{吸引}包中的函数 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GeneSetEnrichment,ImmunoOncology,KEGG,微阵列,通路,RNASeq,Reactome,软件 |
版本 | 1.42.0 |
在Bioconductor | BioC 2.7 (R-2.12)(10.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2.0) |
取决于 | R (>= 3.4.0),AnnotationDbi |
进口 | Biobase,limma,集群,GOstats,图形,统计,reactome.db,KEGGREST,org.Hs.eg.db, utils,方法 |
链接 | |
建议 | illuminaHumanv1.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | attract_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | attract_1.42.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | attract_1.42.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/attract |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ attraction |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/attract/ |
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