atSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.atSNP

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见atSNP．

亲和性试验用于识别调节snp

Bioconductor版本:3.12

atSNP进行基序匹配与SNP或参考基因组的亲和测试，以及SNP导致的基序匹配变化。

作者:Chandler Zuo [aut]， Sunyoung Shin [aut, cre]， Sunduz Keles [aut]

维护者:Sunyoung Shin < Sunyoung。Shin在utdallas.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("atSNP")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“atSNP”)

超文本标记语言	R脚本	atsnp-vignette.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，GenomeAnnotation，MotifAnnotation，软件，可视化
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6)
进口	BSgenome，BiocFileCache，BiocParallel，Rcpp，data.table，ggplot2， grDevices，图形，网格，motifStack，rappdirs统计数据,testthat跑龙套,生命周期
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sunyoungshin/atSNP
BugReports	https://github.com/sunyoungshin/atSNP/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	atSNP_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	atSNP_1.6.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	atSNP_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/atSNP
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/atSNP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/atSNP/
软件包下载报告	下载数据