安菲

doi:10.18129/b9.bioc.annaffy

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅安菲

Affymetrix生物元数据的注释工具

生物导体版本:3.12

从生物导体affymetrix注释数据包中处理数据的功能。生产紧凑的HTML和文本报告,包括实验数据和许多在线数据库的URL链接。允许使用各种标准搜索生物元数据。

作者:Colin A. Smith 的Colin>

维护者:Colin A. Smith 的Colin>

引用(从r内,输入引用(“ Annaffy”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ annaffy”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Annaffy”)

PDF R脚本 Annaffy Primer
PDF 参考手册

细节

生物浏览 注解,,,,,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,途径,,,,报告写作,,,,软件
版本 1.62.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年)
执照 LGPL
要看 r(> = 2.5.0),方法,生物酶,,,,go.db,,,,kegg.db
进口 AnnotationDbi(> = 0.1.15),DBI
链接
建议 HGU95AV2.DB,,,,多检验,tcltk
系统要求
增强
URL
取决于我 PGSEA,,,,Webbioc
进口我 A4base
建议我 AffyExpress,,,,Arraytools,,,,生物探测
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 annaffy_1.62.0.tar.gz
Windows二进制 annaffy_1.62.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Annaffy_1.62.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annaffy
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/Annaffy
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/annaffy/
软件包下载报告 下载统计

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