affyQCReport

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyQCReport

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyQCReport

为affyBatch对象生成QC报告

Bioconductor版本:3.12

这个包为AffyBatch对象创建一个QC报告。该报告旨在允许用户快速评估AffyBatch对象中一组数组的质量。

作者:Craig Parman < Craig。帕尔曼在bifx.org>,Conrad Halling , Robert Gentleman

维护者:Craig Parman < Craig。帕尔曼在bifx.org>

引文(从R内,输入引用(“affyQCReport”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("affyQCReport")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“affyQCReport”)

PDF R脚本 affyQCReport:生成Affymetrix QC报告的方法
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel质量控制软件
版本 1.68.0
在Bioconductor BioC 1.7 (R-2.2)(15.5年)
许可证 LGPL (>= 2)
取决于 Biobase(> = 1.13.16),affy晶格
进口 affyaffyPLMBiobasegenefilter,图形,grDevices,晶格RColorBrewersimpleaffy,统计,utils,xtable
链接
建议 tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 BiocCaseStudies
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 affyQCReport_1.68.0.tar.gz
Windows二进制 affyQCReport_1.68.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) affyQCReport_1.68.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyQCReport
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affyQCReport
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affyQCReport/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网