此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyQCReport.
Bioconductor版本:3.12
这个包为AffyBatch对象创建一个QC报告。该报告旨在允许用户快速评估AffyBatch对象中一组数组的质量。
作者:Craig Parman < Craig。帕尔曼在bifx.org>,Conrad Halling
维护者:Craig Parman < Craig。帕尔曼在bifx.org>
引文(从R内,输入引用(“affyQCReport”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("affyQCReport")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“affyQCReport”)
R脚本 | affyQCReport:生成Affymetrix QC报告的方法 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,软件 |
版本 | 1.68.0 |
在Bioconductor | BioC 1.7 (R-2.2)(15.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | Biobase(> = 1.13.16),affy,晶格 |
进口 | affy,affyPLM,Biobase,genefilter,图形,grDevices,晶格,RColorBrewer,simpleaffy,统计,utils,xtable |
链接 | |
建议 | tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | BiocCaseStudies |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | affyQCReport_1.68.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyQCReport_1.68.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | affyQCReport_1.68.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyQCReport |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affyQCReport |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affyQCReport/ |
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