XCIR

DOI:10.18129 / B9.bioc.XCIR

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅XCIR。

XCI-inference

Bioconductor版本:3.12

主题层次分析模型和工具的X染色体失活(XCI)和XCI-escape推理。

作者:升Sauteraud,不管刘大江

维护人员:升Sauteraud < rxs575 psu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“XCIR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“XCIR”)

HTML	R脚本	介绍XCIR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(1.5年)
许可证	GPL-2
取决于	方法
进口	属性,跑龙套,data.table,IRanges,VariantAnnotation,seqminer,ggplot2,biomaRt,readxl,S4Vectors
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/SRenan/XCIR
BugReports	https://github.com/SRenan/XCIR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	XCIR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	XCIR_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	XCIR_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/XCIR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ XCIR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/XCIR/
包下载报告	下载数据