此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见扳手.
Bioconductor版本:3.12
Wrench是一个用于标准化稀疏基因组计数数据的包,例如来自16个宏基因组调查的数据。
作者:Senthil Kumar Muthiah [aut], Hector Corrada Bravo [aut, cre]
维护者:Hector Corrada Bravo
引文(从R内,输入引用(“扳手”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("扳手")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“扳手”)
超文本标记语言 | R脚本 | 扳手 |
参考手册 |
biocViews | 归一化,测序,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | limma,matrixStats,locfit、统计、图形 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,metagenomeSeq,DESeq2,刨边机 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/HCBravoLab/Wrench |
BugReports | https://github.com/HCBravoLab/Wrench/issues |
全靠我 | |
进口我 | metagenomeSeq |
建议我 | PLNmodels |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Wrench_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | Wrench_1.8.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | Wrench_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Wrench |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Wrench |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Wrench/ |
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