TxRegInfra

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxRegInfra

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见TxRegInfra．

转录调控网络多组规范的元数据管理

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了用于监管网络创建的基因组元数据的接口，重点是noSQL解决方案。目前，eqtl、DnaseI超敏位点和数字基因组足迹的定量表示是使用raggeexperimental API的内存外扩展组装的。

作者:文斯·凯里

维护者:VJ Carey

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TxRegInfra")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TxRegInfra”)

超文本标记语言	R脚本	在TxRegInfra垫片
超文本标记语言	R脚本	TxRegInfra——TxRegQuery的类和方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络，软件
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5)，RaggedExperiment(> = 1.3.11),mongolite
进口	方法,rjson，GenomicRanges，IRanges，BiocParallel，GenomeInfoDb，S4Vectors，SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	knitr，GenomicFiles，EnsDb.Hsapiens.v75，testthat，闪亮的，biovizBase(> = 1.27.2),Gviz，AnnotationFilter，ensembldb，ontoProc，rjson，图，TFutils(> = 1.5.4)
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TxRegInfra_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	TxRegInfra_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TxRegInfra_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TxRegInfra
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TxRegInfra
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TxRegInfra/
软件包下载报告	下载数据