TreeSummarizedExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.TreeSummarizedExperiment

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TreeSummarizedExperiment

tresummarizeexperiment:一个S4类的树状结构数据

Bioconductor版本:3.12

treesummarizeexperiment扩展了singlecel实验,以包括矩形数据的行或列上的分层信息。

作者:黄瑞珠[aut, cre],恩斯特[ctb]

维护人员:Ruizhu Huang

引文(从R内,输入引用(“TreeSummarizedExperiment”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" treesummarizeexperimental ")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes(“TreeSummarizedExperiment”)

超文本标记语言 R脚本 树木简介
PDF 参考手册

细节

biocViews DataRepresentation基础设施软件
版本 1.6.2
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 3.6.0),SingleCellExperimentS4Vectors(> = 0.23.18)
进口 方法,BiocGenerics跑龙套,rlangdplyrSummarizedExperiment
链接
建议 ggtreeggplot2BiocStyleknitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包 TreeSummarizedExperiment_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 TreeSummarizedExperiment_1.6.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra) TreeSummarizedExperiment_1.6.2.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TreeSummarizedExperiment
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ treesummarizeexperiment
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TreeSummarizedExperiment/
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