这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TargetScore。
Bioconductor版本:3.12
推断出微目标的后验分布概率模型的可能性microRNA-overexpression fold-changes和基于分数。Variaitonal贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)应用于日志fold-changes和序列的分数获得潜变量的后验microrna的目标。最后计算targetScore sigmoid-transformed叠化加权平均后验的目标组件的所有功能。
作者:李曰
维护人员:李曰< yueli cs.toronto.edu >
从内部引用(R,回车引用(“TargetScore”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TargetScore”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TargetScore”)
R脚本 | TargetScore:推断microRNA目标使用microRNA-overexpression数据和序列信息 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,microrna的 |
版本 | 1.28.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(7.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | pracma,矩阵 |
进口 | |
链接 | |
建议 | TargetScoreData,gplots,Biobase,GEOquery |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.cs.utoronto.ca/ ~ yueli / software.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | TargetScoreData |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | TargetScore_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | TargetScore_1.28.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | TargetScore_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetScore |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TargetScore |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/ |
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