TarSeqQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.TarSeqQC

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TarSeqQC．

定向测序实验质量控制

Bioconductor版本:3.12

该包允许用r来表示目标实验。这是基于当前的包，并包含了对这类实验进行质量控制和快速探索排序区域的功能。生成一个xlsx文件作为输出。

作者:Gabriela A. Merino, Cristobal Fresno, Yanina Murua, Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:Gabriela Merino <美利奴。Gabriela33在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TarSeqQC")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“TarSeqQC”)

PDF	R脚本	TarSeqQC:靶向测序实验质量控制
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，报道，DataImport，质量控制，测序，软件，TargetedResequencing，可视化
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.5.1)，方法，GenomicRanges，Rsamtools(> = 1.9.2),ggplot2，plyr，openxlsx
进口	grDevices, stats, utils，S4Vectors，IRanges，BiocGenerics，reshape2，GenomeInfoDb，BiocParallel，Biostrings，cowplot、图形、GenomicAlignments，Hmisc
链接
建议	BiocManager，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.ar
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TarSeqQC_1.20.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	TarSeqQC_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TarSeqQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TarSeqQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TarSeqQC/
软件包下载报告	下载数据