TMixClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.TMixClust

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TMixClust。

时间序列聚类的基因表达与高斯Mixed-Effects模型和平滑样条函数

Bioconductor版本:3.12

实现时间序列基因表达数据的聚类方法基于mixed-effects模型和高斯变量和非参数三次样条函数估计。该方法可以强劲占高水平的噪音在典型的基因表达时间序列数据集。

作者:莫妮卡Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >

维护人员:莫尼卡Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TMixClust”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“TMixClust”)

PDF	R脚本	与TMixClust聚类时间序列基因表达数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GeneExpression,软件,StatisticalMethod,TimeCourse
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	gss,mvtnorm统计数据,动物园,集群跑龙套,BiocParallel,flexclustgrDevices图形,Biobase,SPEM
链接
建议	rmarkdown,knitr,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TMixClust_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	TMixClust_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	TMixClust_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TMixClust
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TMixClust/
包下载报告	下载数据