该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅TCSEQ。
生物导体版本:3.12
表观基因组和转录时间课程测序数据的定量和差分分析,聚类分析和时间课程时间的时间模式的可视化。
作者:Mengjun Wu
维护者:gmail.com上的Mengjun Wu
引用(从r内,输入引用(“ TCSEQ”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tcseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
BrowseVignettes(“ TCSEQ”)
R脚本 | TCSEQ小插图 | |
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,聚类,,,,差异性,,,,表观遗传学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,时间科,,,,可视化 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(4年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | EDGER,,,,生物基因,,,,RESHAPE2,,,,基因组机,,,,iranges,,,,总结性特征,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,E1071,,,,簇,,,,GGPLOT2,网格,grdevices,统计,utils,方法,Locfit |
链接 | |
建议 | 测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | tcseq_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | tcseq_1.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | tcseq_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/tcseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tcseq/ |
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