TCSEQ

doi:10.18129/b9.bioc.tcseq

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅TCSEQ

时间课程测序数据分析

生物导体版本:3.12

表观基因组和转录时间课程测序数据的定量和差分分析,聚类分析和时间课程时间的时间模式的可视化。

作者:Mengjun Wu ,lei gu

维护者:gmail.com上的Mengjun Wu

引用(从r内,输入引用(“ TCSEQ”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ tcseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

BrowseVignettes(“ TCSEQ”)

PDF R脚本 TCSEQ小插图
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,聚类,,,,差异性,,,,表观遗传学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,时间科,,,,可视化
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(4年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.4)
进口 EDGER,,,,生物基因,,,,RESHAPE2,,,,基因组机,,,,iranges,,,,总结性特征,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,E1071,,,,,,,,GGPLOT2,网格,grdevices,统计,utils,方法,Locfit
链接
建议 测试
系统要求
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 tcseq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 tcseq_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) tcseq_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/tcseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tcseq/
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