tcgabiolinksgui

doi：10.18129/b9.bioc.tcgabiolinksgui

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅tcgabiolinksgui。

“ TCGABIOLINKSGUI：用于分析癌症分子和临床数据的图形用户界面”

生物导体版本：3.12

“ TCGABIOLINKSGUI：用于分析癌症分子和临床数据的图形用户界面。在https://tcgabiolinksgui.shinyapps.io/tcgabiolinks/ https://tcgabiolinksgui.shinyapps.io https://tcgabiolinksgui.shine of Chapo版本中。

作者：tiago chedraoui silva >，antonio colaprico ，catharina olsen colsen ，Michele Cecccarelli，Michele ccccarelli，Gianluca bontempi ，本杰明·P·伯曼

维护者：tiago C. Silva

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tcgabiolinksgui”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ tcgabiolinksgui”）

html	R脚本	1.简介
html	R脚本	2.数据菜单
html		3.分析菜单
html		4.综合分析菜单
html		5.病例研究
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，dnaseq，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，GUI，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，遗传学，，，，甲基化array，，，，网络，，，，途径，，，，测序，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.16.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（4年）
执照	GPL（> = 3）
要看	r（> = 3.3.1），发光的dashboard（> = 0.5.3），tcgabiolinksgui.data
进口	闪亮的（> = 0.14.1），下载器（> = 0.4），网格，DT，，，，情节，，，，readr，，，，maftools，，，，Stringr（> = 1.1.0），总结性特征，，，，Ggrepel，，，，Data.Table，，，，商在，，，，光泽（> = 0.6.2），GGPLOT2（> = 2.1.0），PathView，，，，埃尔默（> = 2.0.0），clusterProfiler， 平行，tcgabiolinks（> = 2.5.5），Shinyjs（> = 0.7），颜色，，，，芝麻，，，，丝绸（> = 0.61）
链接
建议	测试，，，，dplyr，，，，尼特，，，，roxygen2，，，，DevTools，，，，rvest，，，，XML2，，，，生物使用，，，，动画，，，，潘德
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	tcgabiolinksgui_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	tcgabiolinksgui_1.16.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	tcgabiolinksgui_1.16.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcgabiolinksgui
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/tcgabiolinksgui
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/tcgabiolinksgui/
软件包下载报告	下载统计