TBSignatureProfiler

DOI:10.18129 / B9.bioc.TBSignatureProfiler

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TBSignatureProfiler。

配置文件使用结核病RA-Seq数据通路的签名

Bioconductor版本:3.12

签名的结核病恶化、结核病和其他结核病国家创建了。这个包很容易配置文件使用这些签名和共同签名RNA-Seq数据分析工具,包括分配、GSVA, ssGSEA。

作者:大卫•詹金斯(aut (cre)曰赵(aut), w·埃文约翰逊(aut),奥布里奥多姆(aut),基督教的爱(aut)

维护人员:David Jenkins dfj bu.edu > <

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TBSignatureProfiler”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TBSignatureProfiler”)

HTML	R脚本	介绍TBSignatureProfiler
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	分配(> = 1.23.1),GSVA,