TAPSEQ
doi：10.18129/b9.bioc.tapseq
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅TAPSEQ。
Tap-Seq的目标SCRNA-SEQ底漆设计
生物导体版本：3.12
Tap-Seq使用的靶向单细胞RNA-SEQ的设计引物。使用Primer3创建针对靶基因面板的序列模板和设计基因特异性引物。可以通过爆炸来估计潜在的非目标。需要Primer3和BlastN的工作装置。
作者：Andreas Gschwind [AUT，CRE]
，Lars Velten [aut]，Lars Steinmetz [AUT]
维护者：andreas gschwind
引用（从r内，输入引用（“ Tapseq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tapseq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ tapseq”）
| html | R脚本 | 选择Tap-Seq的目标基因 |
| html | R脚本 | Tap-Seq引物设计工作流程 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | CRISPR，，，，合并屏幕，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，技术 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.11（R-4.0）（1年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 4.0） |
| 进口 | 方法，基因组签名，，，，基因组机，，，，iranges，，，，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.20.1），GenomeInfodB，，，，BSGENOME，，，，GenomicFeatures，，，，生物弦，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，生物比较 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，GGPLOT2，，，，Seurat，，，，Glmnet，，，，牛仔图，，，，矩阵，，，，rtracklayer |
| 系统要求 | Primer3（> = 2.5.0），Blast+（> = 2.6.0） |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/argschwind/tapseq |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tapseq_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tapseq_1.2.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | tapseq_1.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tapseq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/tapseq |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tapseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
