总结

doi：10.18129/b9.bioc.summarizedBenchmark

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅总结。

进行基准比较的类和方法

生物导体版本：3.12

该软件包定义了用于构建，执行和评估计算方法基准实验的台式设计和总结基准类。SummarizedBenchmark类扩展了远程符号expperiment对象，旨在提供基础架构来存储和比较将不同方法应用于共享数据集的结果。该类提供了一个集成的界面，用于存储元数据，例如方法参数和软件版本以及地面真实（如果可以使用）和评估指标。

作者：亚历杭德罗·雷耶斯[aut]，帕特里克·凯姆斯[AUT，CRE]

维护者：patrick kimes

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ summarizeDbench”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“总结基准”）

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html	R脚本	案例研究：单细胞RNA-seq仿真
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细节

生物浏览	基础设施，，，，软件
版本	2.8.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL（> = 3）
要看	r（> = 3.6），花花公子，，，，总结性特征，，，，S4VECTORS，，，，生物基因， 方法，insctr，，，，rlang，，，，Stringr，utils，生物比较，，，，GGPLOT2，，，，mclust，，，，dplyr，，，，消化，，，，SessionInfo，，，，蜡笔，，，，蒂布尔
进口
链接
建议	icobra，，，，生物使用，，，，尼特，，，，马格里特，，，，ihw，，，，QVALUE，，，，测试，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，林玛，，，，tximport，，，，readr，，，，scrnaseq，，，，飞溅，，，，评分，，，，rnaseqcomp，，，，Biomart
系统要求
增强
URL	https://github.com/areyesq89/summarizeBenchmark//www.anjoumacpherson.com/packages/summarizebenchmmark/
BugReports	https://github.com/areyesq89/summarizebenchmark/issues
取决于我
进口我
建议我	Benchmarkfdrdata2019
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	SummarizedBenchmark_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	SummarizedBenchmark_2.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	SummarizedBenchmark_2.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/summarizebenchmark
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/摘要benchmark
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/summarizebenchmmark/
软件包下载报告	下载统计